根據一項最新研究結果，腸道菌群中的某些菌株與結直腸癌相關，可以作為一種非侵入性、準確、節約成本的診斷試驗。相關內容在線發表於Gut上。
根據一項最新研究結果，腸道菌群中的某些菌株與結直腸癌相關，可以作為一種非侵入性、準確、節約成本的診斷試驗。相關內容在線發表於Gut上。
“雖然之前已有研究發現腸道菌群與結直腸癌之間的關係，但研究結果未達成一致。據我們所知，我們的研究首次嚐試收集現有的微生物標記基因數據並統一處理，” 德克薩斯大學公共衛生學院Manasi S. Shah博士說。“盡管隊列人口、實驗室方法和後續分析有統計學差異，對微生物結果有影響，令人鼓舞的是，我們發現細菌信號顯著與大腸癌相關。”
Shah及其同事對2012年到2016年之間發表的9項研究進行了薈萃分析，采用不同的實驗方法來評估結直腸癌和腸道微生物之間的關係。為了識別一組共同的特征性微生物標誌物，他們評估了來自不同種族人群509份糞便樣本的原始16S rRNA基因序列數據(79例大腸腺瘤，195例CRC，235例對照者)。
他們還比較了兩種不同的生物信息學方法以處理數據：常用的封閉參考操作分類單元分配方法，以及新型菌株特異性方法。
與CRC有關的的特定微生物菌種包括Parvimonas MICRA ATCC 33270，咽峽炎鏈球菌和幾種變形菌門。整個研究中，與對照組相比，這些在來自CRC患者的糞便樣本中“頻繁和顯著增加”。
與對照分類相比，使用這些微生物標誌物分類顯示，封閉參考操作分類單元分配方法AUROC為76.6%，菌株特異性方法80.3%。當結合微生物標誌物與臨床特點、分類準確率超過80%，兩種方法的AUROC分別為83.3%和91.3%。
“微生物研究為先進的診斷和治療提供了巨大的潛能。對於某些疾病，確定微生物為基礎的聯係已經相對簡單。然而，對於大多數人，研究界仍然是通過篩查我們設法了解的有關微生物如何影響疾病發生和進展、為我們提供快速、準確診斷的數據，”貝勒醫學院病理學和免疫學助理教授Emily B. Hollister博士說。“微生物與結直腸癌聯係統一模式的識別代表了這些努力的重要一步。”
原始出處：
Shah MS， DeSantis TZ， Weinmaier T， et al. Leveraging sequence-based faecal microbial community survey data to identify a composite biomarker for colorectal cancer. Gut. 2017 Mar 24.
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