結直腸癌是世界上最常見的癌症之一。雖然結直腸癌患者組織的基因組突變和單核苷酸多態性已經被廣泛研究，但其表觀基因組狀態仍然不清楚。在此，結合基因組和轉錄組分析，我們使用測序技術（ChIP-Seq）在全基因組水平上對結直腸癌配對患者組織(同一患者的腫瘤和鄰近組織)的活性增強子進行了分析。
為了建立CRC患者組織活性增強子的全麵基因組視圖，我們共收集了80對CRC患者的組織(腫瘤及其鄰近組織)。組織采集自武漢大學中南醫院(中國武漢)接受手術治療的患者，采集時無特定標準。患者主要來自華中地區，特別是湖北省。我們優化了ChIP-Seq技術協議，並對這些樣本進行了H3K27ac 測序技術，以及相應的mRNA和輸入DNA測序。部分樣本在研究中失敗，最終我們從74個CRC組織和73個本地組織獲得了高質量的測序數據，其中73對配對(圖1A，補充圖S1，補充數據1)。我們還對43對組織進行了H3K4me3測序。我們總共產生了524個高質量的測序樣本，包括147個H3K27ac, 86個H3K4me3, 144個RNA-Seq和147個基因組測序樣本(Sup. Data 2)，這為CRC研究提供了重要的表觀基因組信息。
圖1ACRC患者組織中活性增強子的注釋
補充圖S1:（A）74例大腸癌患者的臨床資料參與我們的研究。（B）曲線圖顯示CRC患者的臨床信息統計。
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