在癌症治療過程中，生物標誌物通常能被用來指導療法的決策和預測患者的治療結局，然而，研究人員通常很難識別出適當的生物標誌物，這些標誌物能夠持續複製並且很容易利用有限的患者樣本來進行分析，近日，一篇發表在國際雜誌Cancer Research上題為“Tumor Expression Quantitative Trait Methylation Screening Reveals Distinct CpG Panels for Deconvolving Cancer Immune Signatures”的研究報告中，來自Moffitt癌症研究中心等機構的科學家們通過研究根據一種被稱為甲基化的遺傳修飾來識別出特殊的生物標誌物，其或能用來預測腫瘤免疫環境的類型和患者的治療結局。

        科學家識別出基於腫瘤的甲基化模式或許能作為特殊的癌症生物標誌物。

        基因往往會受到特定修飾的高度調節，這些修飾要麼會促進或阻斷基因的表達，一種類型的表觀遺傳學修飾稱之為甲基化，其主要包括將甲基化基團添加到基因的特定區域，通常情況下，基因啟動子區域高水平的甲基化往往與較低水平的基因表達有關，最近，有研究表明，基因甲基化的模式或許是一種潛在的生物標誌物，利用甲基化作為生物標誌物相比利用基因表達生物標誌物而言往往擁有多個優勢，包括可重複性和穩定性，這些特性或許就使其更易於在臨床上使用，不同的測試技術之間的差異較小，以及能利用冷凍或固定在甲醛中並嵌入到石蠟中的組織標本。

        目前，細胞溶解活性評分是一種成熟的生物標誌物，其能基於基因表達來預測腫瘤浸潤性淋巴細胞的存在，腫瘤浸潤性淋巴細胞是一類能從血液中移出並進入腫瘤的特殊免疫細胞，腫瘤中高水平的腫瘤浸潤性淋巴細胞或與患者預後改善直接相關，細胞溶解活性評分或能通過測定基因表達的模式來預測腫瘤浸潤性淋巴細胞的存在，尤其是細胞毒性T細胞。這項研究中，研究人員想通過研究識別出那些比常用的生物標誌物更好的生物標誌物，比如細胞溶解活性評分(用於識別冷/熱腫瘤)，研究人員提出了基於腫瘤的表達定量形狀甲基化的概念，即將基因甲基化模式與基因表達相關聯來識別出潛在的生物標誌物。研究人員專注於將黑色素瘤作為一種疾病模型，並評估是否其能識別出特定的甲基化特征，從而幫助預測腫瘤的免疫環境是什麼樣子以及患者的治療結局。

        隨後研究人員發現，黑色素瘤樣本的甲基化序列或能作為細胞溶解活性評分的替代生物標誌物，並能預測腫瘤中免疫環境的類型，通過進行更有針對性的靶向性分析，研究人員確定，稱之為TCF7的單一基因的甲基化模式或能幫助預測是否腫瘤中的T細胞具有抗腫瘤特性，結果發現，TCF7的特征結合細胞溶解活性得分或能幫助預測患者的治療結局。具體而言，具有較低TCF7特征和較高細胞溶解活性得分的黑色素瘤患者相比其它特征組合的患者而言擁有較長的生存期，研究人員證實了在其它腫瘤中較低TCF7特征/較高細胞溶解活性評分之間的關聯，包括腎髒癌症、食道癌等，此外，研究人員還確定，TCF7的特征或能用來預測不依賴於其它變量的患者的結局。

        研究者Xuefeng Wang指出，盡管後期還需要進行更多的研究，目前的分析結果表明，通過基於腫瘤的表達定量特征甲基化篩查來確定免疫組學狀態或能幫助準確預測患者的治療結局，這一研究發現也為解鎖用於個性化療法決策的潛在新型靶點提供了新的希望，其類似於指紋或虹膜掃描，就好像雜誌封麵藝術中的那樣。綜上，本文研究結果表明，基於腫瘤的基因表達定量特征甲基化模式或許代表了一類不同的潛在生物標誌物，其或能用於預測患者的治療預後和機體免疫狀態。