會議介紹

        基因組科學(第32期/總52期)研習班通知

        辦學曆史：16年(2002-2017)

        開班時間：2017年08月18日-25日(其中18日為全天報到日，19日開始上課)

        上課內容：基因組學、蛋白質組學、係統生物學

        上機實習內容：

        1.基因組數據注釋和功能分析;2.轉錄組數據分析;3.蛋白質結構與功能分析;4.係統生物學軟件實習;5.蛋白質組學數據分析。

        隨著眾多生物基因組測序項目的完成，生物學數據正在加速度增長。如何科學地分析和注釋這些高通量數據，已成為生物學工作者急需學習和解決的問題。

        浙江大學“基因組科學”研習班邀請北京基因組所於軍教授、胡鬆年教授為您講授基因組學基礎知識和前沿進展、基因轉錄組的測定及分析、二代測序等實驗技術的關鍵事項;浙江大學楊軍教授、陳銘教授等講解係統生物學及高通量分析研究方法和思路。

        本研習班多次獲得浙江大學優秀項目創新獎，目前已舉辦51期，學員來自全國30餘個省市，累計培訓學員5100餘名。每次研習班不乏教授、博導參加，更受到博士後、碩博生等年輕學者的青睞。他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯係，不少學員通過本研習班建立了長期協作關係，共同申請國家973、863課題，共同發表論文，其中不少優秀的研究成果，已在SCI期刊上發表。

        一、培訓班上課內容

        上課內容涵蓋“基因組學—蛋白質組學—係統生物學”的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。

        核心課程包括：

        1.基因組的比較研究、DNA測序技術原理與進展(講課人：於軍教授)

        2.轉錄組的測定與分析、大規模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與精準醫學(講課人：胡鬆年教授)

        3.係統生物學建模分析及高通量分析技術應用(講課人：楊軍、陳銘教授等)

        4.蛋白質組學概論及應用(講課人：鍾伯雄教授)

        二、培訓班上機內容

        上機實習課采用“跟我學”方式，學習實踐各類基礎生物信息學軟件，每人一台PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數據分析的基本方法。

        主要內容如下：

        實習一：基因組數據注釋和功能分析

        通過序列比對工具BLAST的學習，了解基因功能注釋的原理;介紹多序列聯配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握係統發生樹繪製的基本方法，認識基因複製在進化上的功能。

        實習二：轉錄組數據分析

        介紹轉錄組數據分析的基本流程及其原理;通過對tophat、cufflinks、R等轉錄組數據分析工具的介紹及演示，了解基於二代測序數據的轉錄組分析流程及常用分析方法;利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉錄組數據的生物學意義。

        實習三：係統生物學軟件實習

        使用TM4軟件來實現芯片的數據采集，低質量過濾，標準化處理及聚類等可視化分析;使用GenMAPP軟件挖掘芯片數據在代謝途徑中的生物學意義;介紹NCBI GEO數據庫，學習檢索和提交芯片數據。

        實習四：蛋白質結構與功能分析

        從數據庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始，接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析，預測目標蛋白的生物功能。

        實習五：蛋白質組質譜分析

        利用Cytoscape係統生物學分析軟件，分析蛋白-蛋白相互作用，展示分子網絡係統，並與基因表達等數據整合。

        三、培訓對象

        1.無生物信息學背景，希望了解生物信息學的學員;

        2.計劃開展各類組學研究的科研人員;

        3.已有組學數據需了解分析方法的研究人員;

        4.有誌從事生物信息學相關工作的學生或者技術人員。

        四、報名方法

        若有參加意向，請直接報名，我們會即刻回函並在浙江大學繼續教育係統錄入，待排定課表後發給您詳細課程表。待您再次確認後，發給您報到通知並排定上機號。培訓結束，發放浙江大學繼續教育證書。

        五、教材

        “DNA和蛋白質序列數據分析工具”(第三版)，薛慶中等編著，科學出版社出版2012年6月發行。

        “基因組學概論”(第二版)，薛慶中等編著，科學出版社出版2016年1月發行。

        會務組提供。

        六、其他事項

        收費標準：注冊費為￥3800/人(包含培訓費、教材費、資料費;現金、刷卡或轉賬)食宿可統一安排，費用自理。

        聯係人：代成林18757558672 谘詢電話：0571-88206579

        電子郵件地址：genetrain@zju.edu.cn;daichenglin@zju.edu.cn。