在一項研究中，研究人員已經確定了最常見的兒童癌症的多種新亞型 - 這些研究可能會改善高風險患者的診斷和治療。相關結果發表在最近一期的《Nature Genetics》雜誌上。
研究人員使用整合基因組分析(包括RNA測序)來確定近2,000名兒童和成人的B細胞急性淋巴細胞白血病(B-ALL)的基因組圖譜。 B-ALL是ALL中最常見的形式，也是兒童中最常見的癌症。 B-ALL仍然是兒科癌症死亡的主要原因。
研究人員確定了23種B-ALL亞型，包括8種新亞型，具有不同的基因組和臨床特征以及結果。亞型患病率通常隨年齡而變化。現在，超過90%的B-ALL病例可按亞型分類，而幾年前這一比例為70%。
“B-ALL具有顯著的分子多樣性，我們和其他人已經用它來改進分類，推動精準藥物的開發，以改善B-ALL的治療和結果，”相應的作者Charles Mullighan，說道：“精確醫學的一部分是準確的分子診斷，本研究為更多患者提供了這種診斷。”
轉錄因子基因PAX5的改變定義了兩種新的亞型，包括PAX5 P80R，作為由點突變引發的第一個淋巴母細胞白血病。 “雖然二次突變是必要的並且通常涉及激酶信號傳導，但我們表明這一點突變會損害B淋巴細胞的發育並促進小鼠B-ALL的發育，”作者說道。
其他PAX5亞型，PAX5改變，由基因的多種改變定義，包括序列突變或與24個其他基因之一重排。 PAX5亞型共同占了之前未分類的B-ALL病例的近10%。
新的亞型包括主要發生在成人中的高風險B-ALL。它通過用MYC或BCL6重排轉錄因子BCL2來定義。 “這種亞型有一個令人沮喪的診斷，”Mullighan說。 “對這種亞型定義重排的認識可能會為患者帶來替代療法。”相反，通過基因DUX4的重排定義的亞型與成人的良好預後相關，如先前在兒童中觀察到的。
該研究證明了RNA測序能夠識別多種類型的基因組改變，突出了該技術在白血病診斷中的實用性，特別是在沒有全基因組測序的情況下。該研究中的實例包括染色體重排，導致融合基因，基因表達譜和其他改變。
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