基礎醫學

RNA的甲基化與去甲基化修飾

作者:佚名 來源:生物穀 日期:2019-12-11
導讀

         德國慕尼黑的路德維希-馬克西米利安大學(LMU)研究人員發現了細菌RNA中一種新型的化學修飾形式。顯然,隻有當細胞處於應激狀態時,這種修飾才會附著在分子上,並且在恢複過程中會迅速去除。

關鍵字:  RNA | 甲基化 | 去甲基化 

        德國慕尼黑的路德維希-馬克西米利安大學(LMU)研究人員發現了細菌RNA中一種新型的化學修飾形式。顯然,隻有當細胞處於應激狀態時,這種修飾才會附著在分子上,並且在恢複過程中會迅速去除。

        核糖核酸(RNA)在化學形式上與DNA密切相關,而DNA是所有細胞中遺傳信息的載體。實際上,RNA本身在將遺傳信息轉換成蛋白質的過程中起著核心作用。

        像DNA一樣,RNA分子由稱為核堿基的四種不同類型亞基的序列組成,它們通過糖-磷酸酯鍵相互連接。在所有生物中,可以對這些亞基進行選擇性修飾,以調節其相互作用和功能。

        現在,化學係Stefanie Kellner博士與Kirsten Jung(LMU微生物學教授)合作發現了細菌RNA的一種新穎的-生物化學上非常不尋常的修飾。當微生物受到壓力時會附著修飾物,當條件恢複正常時可立即將其去除。新發現發表在在線雜誌《Nature Communications》雜誌上。

        DNA和RNA均可通過甲基化修飾,即甲基(CH3)取代基與核苷酸的連接。另外,細菌用含有硫原子的官能團修飾RNA,作為調節蛋白質合成的一種手段。一種這樣的修飾代替胞苷堿中2位的氧。在大腸杆菌中,Kellner和她的同事現已鑒定出這種改性的含硫堿的一種以前未知的形式。Kellner說:“在這種情況下,細菌在胞苷的硫基被甲基化。通過硫取代基的偶聯將胞苷轉化為2-甲基硫代胞苷,或簡稱為ms2C。”

        進一步的實驗表明,當細菌在壓力下通過向生長培養基中添加有害化學物質或抗生素時,ms2C主要出現在RNA中。盡管這種損害會對蛋白質翻譯產生負麵影響,但這並不是對細菌致命的打擊。

        有趣的是,細菌擁有一種可以隨後消除甲基化損傷的酶。該團隊借助一種稱為NAIL-MS(核酸同位素標記質譜聯用)的相對較新的分析技術,成功地表征了修複機製。“通過這種方式,我們能夠在活細胞中證明修飾的RNA不會被降解。相反,它是通過甲基酶促分離來修複的。”

        由於修複過程是在RNA修飾後的1-2小時內完成的,因此研究人員認為該細胞已經“做好了準備”以應對損傷。可以想象,含硫的RNA堿基充當遊離甲基的清除劑,這些遊離甲基是由於壓力的直接結果而產生的,從而阻止了它們修飾DNA或其他蛋白質。由於細菌細胞中充滿了RNA分子,因此它們可以作為有效的排毒機製來清除反應性化學基團。

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