對大腸杆菌(E.coli)的首次大規模遺傳學研究表明,耐藥“超級細菌”並不總是與其他菌株競爭,大腸杆菌來自英國血液感染患者。 Wellcome Trust Sanger研究所及其合作者的研究表明,新型大腸杆菌經常出現,但與其他一些感染不同,耐藥菌株並不是感染的主要原因。
對大腸杆菌(E.coli)的首次大規模遺傳學研究表明,耐藥“超級細菌”並不總是與其他菌株競爭,大腸杆菌來自英國血液感染患者。 Wellcome Trust Sanger研究所及其合作者的研究表明,新型大腸杆菌經常出現,但與其他一些感染不同,耐藥菌株並不是感染的主要原因。
研究人員今天在Genome Research發表了一項研究,檢測了十多年來從血液感染患者中分離的大量大腸杆菌,其中一些對許多抗生素具有抗性,而另外一些則不具有抗性。研究人員發現,感染可以由超過200種大腸杆菌引起。隨著時間的推移,包括多藥耐藥大腸杆菌在內的新菌株被發現在收集物中,但是這些菌株很快與菌群中的其他菌株達成了平衡,而不是隨著時間的推移而增加。
大腸杆菌是人類消化道天然攜帶的非常常見的細菌,但也是血液感染的主要原因。2014年英國有35,676例,通常來自於尿路或胃腸道感染的傳播。
研究者已經廣泛研究了某些大腸杆菌菌株,如耐多種抗生素的“超級”菌株ST131。但是這項研究采用了不同的方法 - 而不僅僅著重於抗生素耐藥菌株,這項研究進一步收集了1509種大腸杆菌,其大部分來自英國各地,時間超過11年。研究人員利用全基因組測序,發現了228種不同的大腸杆菌菌株。
該研究記錄到ST131於2002年首次出現在英國。在短時間內,ST131分離株的數量與其他類型的細菌達到了平衡。大約在同一時間,另一種類型(ST69,不是多重耐藥菌株)也已出現,並且在總體菌群中再次迅速達到平衡。
Wellcome Trust Sanger研究所和倫敦衛生與熱帶醫學學院的Sharon Peacock教授說:“這些研究結果表明,新型大腸杆菌的出現並不少見,並且必須跟其他類型的成功競爭成為人類感染的主要原因,這種平衡的原因可能與所有細菌不斷相互競爭取得一席之地(如腸道)有關。
該研究發現五種菌株占比超過分離株的一半。“超級細菌”ST131是第二常見的菌株,抗生素敏感菌株ST73是最常見的菌株。研究人員發現,不同的菌株攜帶不同的基因組,可能成為其成功的基礎。其中許多是使其能夠在腸道或尿道中生存的毒力基因,但有些是使它們與其他細菌更好競爭的基因。
Sanger研究所的Julian Parkhill博士說:“我們的研究表明,大腸杆菌不同菌株的成功有許多原因,其中包括細菌之間的競爭,以及與人宿主的相互作用和抗生素耐藥性。這表明導致血液感染的大腸杆菌的最終來源是廣泛社區中多種細菌群體。”
Wellcome耐藥感染主管Tim Jinks表示:“大腸杆菌是血液感染的主要原因,這項研究有助於說明多藥耐藥菌株的獲取和傳播具有難以置信的複雜性。尋找新的有效治療多藥抗性菌株仍然是重中之重。
原始出處:
Kallonen,T. et al.Systematic longitudinal survey of invasive Escherichia coli in England demonstrates a stable population structure only transiently disturbed by the emergence of ST131.Genome Research. Aug 2017.
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