全科醫學

基於ITS2序列的茄科酸漿屬植物的DNA分子鑒定

作者:楊俊嶺 整理 來源:醫學論壇網 日期:2016-05-19
導讀

           近期,遼寧中醫藥大學研究人員發表論文,旨在利用內轉錄間隔區2(internaltranscribedspacer2,ITS2)序列對茄科酸漿屬植物進行分子鑒定。研究指出,ITS2序列在近緣物種間的係統學研究、品種的鑒定方麵具有較大的應用潛力,適用於酸漿屬植物的分子鑒定。該文發表在2016年第08期《中國實驗方劑學雜誌》上。   對酸漿屬與散血丹屬植物樣本的ITS2序列進行逆轉錄-聚合酶鏈式反

  近期,遼寧中醫藥大學研究人員發表論文,旨在利用內轉錄間隔區2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列對茄科酸漿屬植物進行分子鑒定。研究指出,ITS2序列在近緣物種間的係統學研究、品種的鑒定方麵具有較大的應用潛力,適用於酸漿屬植物的分子鑒定。該文發表在2016年第08期《中國實驗方劑學雜誌》上。

  對酸漿屬與散血丹屬植物樣本的ITS2序列進行逆轉錄-聚合酶鏈式反應(RT-PCR)擴增和測序。為擴大研究範圍,從Gen Bank中下載了上述2個屬植物樣本的ITS2序列。所有序列經Codon Code Aligner V3.0.1軟件拚接,DNAMAN軟件比對分析,采用MEGA 5.10計算相關數據,基於K2P模型構建鄰接聚類樹。從ITS2數據庫中獲得所測樣本及下載序列的ITS2二級結構信息,分析各樣本間ITS2序列二級結構的差異。

  結果顯示, 從鄰接聚類樹分析可知,所有樣本被聚為兩大支。酸漿屬植物自成1支,散血丹屬植物為1支,且除極個別樣本外,2個屬的各物種種內樣本可各為1支,表現出單係性;且每2支之間的Bootstrap支持率均很高。

   相關鏈接:http://med.wanfangdata.com.cn/Periodical/zgsyfjxzz

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