推薦建議6：在抗病毒治療過程中，應至少每3個月監測1次ALT、HBeAg或HBV DNA（ⅠA）。若使用替諾福韋或者阿德福韋，還應監測腎功能（ⅠA）。用替比夫定治療時應監測肌力是否減弱（ⅢA）。在應用幹擾素治療期間，必須強製性監測全血細胞計數和其他的藥物不良反應（ⅠA）。

　　推薦建議7：在抗病毒治療結束後，頭3個月內應當每月監測ALT和HBV DNA以發現早期複發，以後每三個月監測一次。若無症狀出現，以後每3個月（對於肝硬化患者）到6個月（對於已產生應答的患者）監測1次（ⅡA）。對於無應答的患者，應進一步監測HBV標誌物，以便識別延遲應答和在有指征時重新治療（ⅡA）。

　　推薦建議8：對於常規幹擾素，目前推薦的療程為HBeAg陽性患者4～6個月（ⅠA），HBeAg陰性患者至少1年（ⅠA）。對於PegIFN，推薦的療程為12個月（ⅠA）。對於胸腺素α1，推薦的療程為HBeAg陽性患者（ⅠA）和HBeAg陰性患者（ⅡB）均為6個月。

　　推薦建議9：對於口服抗病毒藥物，在HBeAg陽性患者，當證實至少持續12個月出現HBeAg血清學轉換伴HBV DNA檢測不出，可考慮停藥（ⅡA）。在HBeAg陰性患者，如果HBsAg仍然陽性尚不清楚需要持續治療多長時間，但在治療至少持續2年並間隔至少6個月的3個不同時間點檢測不出HBV DNA （ⅡA），可以考慮終止治療。對於依從性好的初治患者在開始治療3個月時出現原發治療失敗或者在第6個月時病毒控製不理想的，如果已用拉米夫定，替比夫定或者阿德福韋治療，可以改用更強的或加用沒有交叉耐藥的藥物治療（ⅢA）。

　　推薦10-1：對於育齡婦女，尚未懷孕者優先考慮選用基於幹擾素的治療（ⅠA），在幹擾素治療期間不宜懷孕。懷孕需要治療的可以用妊娠B級口服藥治療（ⅡA）。

　　推薦10-2：為了防止母嬰傳播，對於HBV DNA＞2×106 IU/mL的妊娠婦女在妊娠晚期可以用替比夫定（ⅡA）治療，替諾福韋也可作為選擇之一（ⅢA）。

　　推薦建議11：包括有替諾福韋和恩曲他濱/拉米夫定在內的抗逆轉錄病毒藥，是大多數HIV合並感染HBV患者的主要治療方式。如果CD4 > 500 cells/mm3而目前不需要進行抗逆轉錄病毒治療的情況下，可以選擇阿德福韋或者PegIFNα治療（ⅡA）。

　　推薦建議12：在同時存在HCV或HDV感染的患者，應注意鑒別哪一種病毒引起的肝損害為主，並據此製定治療方案給予治療（Ⅲ）。

　　推薦建議13：對於存在明顯或即將發生肝功能失代償、且初治的患者，選用恩替卡韋或者替諾福韋（ⅠA）。但對於初始用口服抗病毒藥的患者也可選用替比夫定、拉米夫定治療或者阿德福韋（ⅠB）。對於這類人群必須監測腎功能和乳酸，尤其是MELD平分高於20的患者（ⅢA）。