早在上世紀20年代回國從事醫療工作伊始，沈克非就加入了中華醫學會。由於深厚的學術造詣和對學會的無私奉獻，1943年5月，年僅45歲的沈克非即當選為中華醫學會第14任會長，從此為學會的發展壯大嘔心瀝血近30年。

整頓會務，設計會徽

1945年，沈克非主持召開了學會常務理事會第3次會議，討論並通過修正會費及雜誌費、醫文摘要訂費及發行、恢複成立營業部、圖書館委員會成立等事項，為學會的長遠發展打下堅實基礎。

沈克非主政期間，還主持了當時中華醫學會會徽的設計和審定：學會標記為橢圓形，內繪中國地圖，寫有“中華醫學會”字樣，並繪有蛇與手杖以示醫學之意,顏色采用綠與金黃兩色配合。

複刊雜誌，傾力支持

作為知名的醫學教育家，沈克非對雜誌的發展尤為傾心。在他不遺餘力募集資金的支持下，1943年10月，《中華醫學雜誌》重慶版第1期在歌樂山出版。沈克非在《卷頭語》中指出：“發展會務、出版事業乃本會重要工作之一，除英文版雜誌已在美、在蓉分出二種外，本刊已在渝複刊”。

1943年，國際外科學會中國支會在重慶成立，會所設重慶，沈克非（前排右三）當選為第一任會長

沈克非一向倡導要以實際行動熱愛我們自己的雜誌，他一生中絕大多數優秀的研究成果都是發表在《中華外科雜誌》上。正是他在鑒定後的鼓勵和積極倡導下，陳中偉教授才將世界上首例斷手再植的研究發表在1963年的《中華醫學雜誌》上，為中國人贏得了世界首例成功的報道。

國際交流，倡導踐行

1946年6月聯合國世界衛生組織歡迎中國代表團成員（右四為沈克非）

作為中國外科學的先驅者，沈克非不僅理論水平高超、外科技藝精湛，亦是我國外科界國際學術交流的倡導者和踐行者。他曾多次率團出席國際性學術會議，如1944年的伊朗德黑蘭中東醫學會議、1946年的秘魯第五屆國際外科學術會議、1956年的波蘭國際醫學會議、1957年的墨西哥國際外科年會。

沈克非（左一）、施思明出席1946年6月世界衛生組織籌備及成立大會

沈克非長期擔任國際外科學會中國分會的負責人，也是英國皇家外科學會會員，具有廣泛的國際影響。因此被任命為中國醫學界首席代表參加聯合國世界衛生組織的籌建工作，作為中國政府全權代表出席1946年6月世界衛生組織籌備及成立大會。

1957年10月20~27日，中華醫學會派出沈克非（團長）、孟繼懋、吳英愷、吳在東出席在墨西哥城召開的第17屆國際外科學會大會，圖為沈克非（左一）與國外同道合影。