研究者Peter Thielen和Tom Mehoke花費了多年時間對流感病毒的基因組進行測序研究，如今，隨著新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)在全球範圍內傳播，這些來自約翰霍普金斯應用物理實驗室(APL)的生物學家們也開始將它們研究的重點轉移到SARS-CoV-2上了。

在約翰霍普金斯醫院的分子診斷實驗室內，當臨床醫護人員和醫院工作人員不知疲倦地處理病人的檢測結果時，研究者Thielen和Mehoke正在等待陽性檢測結果;當然，檢測結果呈現陽性並不值得慶祝，但對他們而言卻是了解這種病毒發生快速傳播的關鍵。利用APL實驗室所開發的部分軟件和分子生物學手段，Thielen和Mehoke就能夠使用手持式的DNA測序儀對SARS-CoV-2病毒進行現場基因組測序了。

Thielen表示，相關信息就能幫助我們追蹤病毒的進化，並了解巴爾迪摩市新病例可能來自於哪裏，也能幫助我們預判疾病傳播的時間;首先研究人員能看到病毒的突變速度，這也是繪製病毒傳播圖譜的綜合信息，同時也有助於幫助科學家們開發有效的疫苗，比如，流感病毒會不斷發生變異，這就是為何每天人們都要接種針對不同毒株的流感疫苗的原因。

引發COVID-19的SARS-CoV-2病毒似乎並沒有變異那麼快;當這種病毒第一次在中國被測序時，相關信息就對啟動疫苗研究非常有幫助，如今研究者就是要研究確定這種病毒是否正在遠離其最初的原始序列信息發生了變異，以及其變異的速度到底有多快;基於變異率，早期研究數據表明，其可能僅需要研究人員開發單一的疫苗，而並非像流感病毒那樣每年都需要更新疫苗。

在短期內，這些突變能夠指揮病毒的傳播;隨著美國繼續加強檢測等措施的實施，了解疾病的爆發能力和方式或許就能為公共衛生部門提供另一種評估工具;突變能幫助解釋病毒可能有多長時間不被檢測到，同時還能解釋病例實際上要比診斷出的病毒多得多的假設，也能夠幫助研究人員采取相關措施，比如美國全國範圍內的隔離等。

如今全球各地的科學家們都正在緊鑼密鼓地進行病毒基因組的測序工作，這能夠幫助他們追蹤疫情爆發的來源，比如在加州北部就有新聞報道稱，基因組測序已經能將海灣地區疫情的爆發與公主號遊輪聯係起來;隨著巴爾的摩和華盛頓特區進行了大量的病毒基因組測序工作，研究人員就能夠獲得一定的DNA指紋圖譜，目前Thielen和Mehoke已經完成了首批4個COVID-19樣本的分析，而且還有來自巴爾的摩和華盛頓特區的100多份樣本正在排隊等待進行檢測，預計未來幾周內還會有更多樣本進行測序分析。

研究者Thielen及其同事能夠使用手持式測序儀和筆記本電腦進行遠程操作，而結果出來則需要等待幾天;在過去9個月裏，研究人員召開了兩次研討會來商討如何幫助中低收入國家的科學家們使用手持式測序儀來進行這樣研究工作;目前他們已經對美國本地的科學家們進行了培訓，讓他們能在自己的實驗室進行同類的現場測序分析;進行相關的培訓能讓更多科學家們做好準備以應對未來或會出現的疾病大流行。