基礎醫學

邊切邊補,告別DNA雙鏈完全斷裂!新“魔剪”劍指89%遺傳變異!

作者:佚名 來源:轉化醫學網 日期:2019-10-31
導讀

         基因治療是最具革命性的醫療技術之一,它是以改變人遺傳物質為基礎的生物醫學治療手段。其中以CRISPR/Cas9為代表的基因編輯日新月異的發展極大地推動了基因功能研究進程。但是,“基因魔剪”的應用之路並非一帆風順,技術本身存在的局限性極大地限製了其發展。

關鍵字:  DNA | CRISPR/Cas9 

        基因治療是最具革命性的醫療技術之一,它是以改變人遺傳物質為基礎的生物醫學治療手段。其中以CRISPR/Cas9為代表的基因編輯日新月異的發展極大地推動了基因功能研究進程。但是,“基因魔剪”的應用之路並非一帆風順,技術本身存在的局限性極大地限製了其發展。

        近日,單堿基編輯技術開創者、Broad研究所David Liu教授研究團隊在頂級學術期刊Nature發表了最新的基因編輯研究成果,報道了一種被稱為“prime editing”的新型基因編輯技術。該研究革新了CRISPR/Cas9技術,成功在避免DNA雙鏈斷裂的基礎上增加了可執行基因組編輯的類型,減少了基因插入失控和脫靶效應,提高了精準修正率,有望修正約89%的疾病相關人類遺傳變異體!

        CRISPR/Cas9——“基因魔剪”“魔力”受限

        CRISPR/Cas9技術是一種RNA引導的基因組編輯技術,理論上能對基因進行精確敲除、敲入、替換等,從而探究基因功能、修複致病基因,為構建更高效的基因編輯技術提供了可能。但是,大量實驗結果卻指出CRISPR/Cas9對大多數突變的精準修正效率不高,插入缺失副產物導致的基因紊亂引發了群眾對CRISPR/Cas9的猶豫。那麼,“基因魔剪”“魔力”為何受限呢?

        我們知道,CRISPR/Cas9進入細胞後,CRISPR序列可轉錄出 pre-crRNA和tracrRNA,而pre-crRNA、tracrRNA以及Cas9編碼的蛋白將會組裝成一個複合體。gRNA可通過堿基互補配對靶向目標序列,識別出與crRNA互補的前間隔序列,DNA雙鏈將被解開。crRNA將與互補鏈雜交,而另一條鏈則保持遊離狀態。隨後Cas9蛋白剪切crRNA互補的DNA鏈和非互補的DNA鏈,最終形成雙鏈斷裂(DSB),而生物體自身存在的DNA損傷修複應答機製可將斷裂的上下遊兩端的序列連接起來,從而實現了細胞中目標基因的敲除。

        換言之,CRISPR/Cas9編輯的核心步驟是雙鏈DNA的斷裂,這種斷裂的主要修複方式是非同源末端連接,這是一種錯誤率極高的修複方式,容易發生移碼插入或缺失,進而引發基因功能喪失,這就嚴重限製了CRISPR/Cas9的精準修正率,所以,想要打破這種局限性,就要避免雙鏈DNA的斷裂。

        prime editing——邊切邊補,告別雙鏈斷裂

        既然不想DNA雙鏈一起斷裂,那就隻能分開修正,也就是說要對突變的位置進行“定點”修正。如何實現呢?研究人員將Cas9蛋白與逆轉錄酶,以及一種特殊的gRNA——pegRNA合成一個複合體。pegRNA不僅可以搜索特定的DNA位點,還能在Cas9-逆轉錄酶融合蛋白切割一條DNA鏈後直接用預編輯的遺傳信息替換靶DNA序列,隨後另一種可精確修複的DNA修複方式——同源修複啟動,將新的遺傳信息接入DNA序列。而另一條DNA鏈隻要將這些步驟再實施一次就可正確編輯。這就實現了“邊切邊補”,徹底杜絕了DNA雙鏈同時斷裂引發的錯配危機。

        研究人員指出,prime editing技術能進行12種單堿基的轉化,其最多可以插入44個堿基或刪除80個堿基。他們在人體細胞執行了超過175次的編輯,確定這項技術比傳統CRISPR/Cas9基因修正的精確率更高,效果更好,而且減少了副產物,更降低了脫靶率!

        這項研究指出了一種新穎的基因編輯方案,克服了傳統CRISPR/Cas9的盲點,這就意味著prime editing技術有望成為未來基因編輯領域更為絢爛的明星。當然這需要更多的時間和實驗對其效果加以證明,我們靜候佳音!

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