基礎醫學

開發出更加高效的CRISPR–Cas12a變體

作者:佚名 來源:生物穀 日期:2019-12-28
導讀

在一項研究中,來自美國麻省總醫院、哈佛醫學院和麻省理工學院的研究人員設計了能夠靶向更廣泛的前間隔序列鄰近基序(protospacer adjacent motif, PAM)的Cas12a變體。

關鍵字: CRISPR–Cas12a

在一項研究中,來自美國麻省總醫院、哈佛醫學院和麻省理工學院的研究人員設計了能夠靶向更廣泛的前間隔序列鄰近基序(protospacer adjacent motif, PAM)的Cas12a變體。相關研究結果發表在Nature Biotechnology期刊上,論文標題為“Engineered CRISPR–Cas12a variants with increased activities and improved targeting ranges for gene, epigenetic and base editing”。在這篇論文中,他們描述了他們設計的這些Cas12a變體,以及與傳統的Cas12a核酸酶進行比較時,它們如何作出表現。

利用諸如Cas12a之類的基因剪接工具開展實驗的科學家們想知道這些工具是否有朝一日能夠用於編輯人類基因組,以便改善健康和幸福感---比如移除導致遺傳性疾病的基因。盡管這樣的研究具有很大的前景,但是現有的基因剪接工具當前被認為太不可靠而無法用於人體中。比如,它們有時會切割錯誤的基因組位點,或者在插入正確的片段時遇到問題。人們還擔憂切割靶標---PAM---附近的部分DNA片段受到損傷。在這項新的研究中,這些研究人員設計了Cas12a核酸酶的變體,他們聲稱這些變體提供了擴大的靶向範圍,包括一些以前難以接近的PAM。

這些研究人員報道特別地,一種稱為enAsCas12a的變體並不需要擴展的輸血傳播病毒(extended transfusion-transmissible virus, TTTV)PAM,當然,野生型AsCas12a需要這種TTTV PAM。與AsCas12a野生型相比,這種變體在典型的TTTV PAM存在時平均具有兩倍高的基因組編輯活性。它的靶向範圍擴大了:增加了七倍。他們進一步報道他們成功地將來自enAsCas12a的一部分突變片段移植到AsCas12a上來改善後者的活性。他們聲稱,開發出的enAsCas12a允許更高效地進行多重基因編輯,並提供內源性基因激活和C→T堿基編輯。為了降低利用enAsCas12a觀察到的高於正常的脫靶效應,他們還設計了另一種稱為enAsCas12a-HF1的變體。

這些研究人員做出結論,他們設計的AsCas12a變體為科學家們提供了大大改進的靶向範圍、靶向活性以及使用Cas12a核酸酶進行基因剪接時具有更高的精確度。

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