呼吸

與新冠病毒賽跑:科學家們設計了追蹤COVID-19的新方法

作者:佚名 來源:生物穀 日期:2020-04-26
導讀

         在一個完美的場景中,單獨的COVID-19測試將被廣泛且容易地訪問。實際上,檢測仍然短缺,而且可能的病例數量遠遠超過檢測能力,使該病的流行和發展軌跡難以衡量。

關鍵字:  COVID-19 

        在一個完美的場景中,單獨的COVID-19測試將被廣泛且容易地訪問。實際上,檢測仍然短缺,而且可能的病例數量遠遠超過檢測能力,使該病的流行和發展軌跡難以衡量。

        但耶魯大學的研究人員正在開發創造性的方法來跟蹤病毒的傳播--通過算法、環境采樣、基因組測序以及一種被稱為血清學的測量血液中抗體的方法。研究人員希望,這些努力(其中許多仍處於早期階段)將提供有關病毒傳播範圍的寶貴信息,並讓他們能夠估計生活何時可能恢複,就像我們過去所知道的那樣。

        耶魯大學醫學院實驗室醫學和免疫生物學助理教授Ellen Foxman博士說:"這是一種幾個月前從未在人類身上出現過的新病毒,我們正在與之對抗。需要兩到三個月時間開發的測試,我們正努力在兩到三周內開發出來。"

        Foxman是兩個臨床實驗室副主任--由Marie-Louise Landry博士領導的臨床病毒學實驗室的,該實驗室開發了COVID-19測試,耶魯紐黑文醫院每天使用該測試測試200人;還有臨床免疫學實驗室,他們正在開發血清學測試。她也是耶魯COVID-19實驗室工作組的成員之一,其他成員還包括Landry、流行病學家Nathan Grubaugh、免疫生物學家Akiko Iwasaki和耶魯大學公共衛生學院流行病學係主任和教授Albert Ko。

        "現在,我們正在奠定基礎,建立隊列研究,"Ko說。"這是一種全新的病原體。我們需要知道它是如何感染人的,為什麼他們會生病,如果他們獲得了免疫力,他們是否會再次被感染。"

        今年2月,隨著美國對該病毒的擔憂加劇,耶魯大學的教授專家被請來預測這種疾病在當地的傳播。

        耶魯大學全球健康研究所所長Saad Omer是耶魯大學校長Peter Salovey的COVID-19谘詢小組的成員,他開發了一種算法來評估病毒可能在當地的傳播。這項工作幫助大學領導們決定在春季學期期間將課程搬到網上,並製定在家工作的協議。

        耶魯大學醫學院全球衛生研究副院長兼醫學(傳染病)教授Omer和耶魯大學公共衛生學院流行病學教授Susan Dwight Bliss表示:"我們必須弄清楚--這些信息在哪裏引發了決策?"

        Omer曾在全球範圍內研究呼吸係統疾病和疫苗,他根據教員、學生和員工的出行和通勤地點設計了這個算法,並利用它來估計可能在耶魯社區內的傳播。

        Omer說:"我看到疫情爆發。在回應疫情中,走在潮流的前麵是很重要的。"

        隨著確診病例的出現,耶魯大學的環境工程師Jordan Peccia開始研究另一種評估病毒在紐黑文社區傳播範圍的方法--對當地廢水進行環境采樣,其中包含了大量病原體和毒素的證據。Peccia說,這種方法甚至被用於揭示一個城市的藥物使用信息。

        "即使該州沒有確診病例,我們也能在廢水中看到這種情況," 化學與環境工程Thomas E. GoldenJr教授Peccia道。

        他和他的團隊每天從紐黑文的汙水處理場收集樣本,將樣本轉移到實驗室中零下80度的冰箱中,提取RNA來測定汙水中冠狀病毒的濃度。在流行病學家的幫助下,他們將把這些濃度數據與已確診的COVID-19病例的數量進行比較,從而估算出更廣泛的紐黑文人群中實際病例的可能數量。

        Peccia說:"我們希望利用這些數據來幫助指出我們在疫情中的位置。我們也在嚐試尋找一種創新的方法來開發一種疾病在人群中傳播的早期預警係統。"他希望他們的工作能持續整個夏天。

        "這是一個漫長的遊戲," Omer說。"我們不知道到底有多少人被感染。我們不知道有多少人會患上這種疾病。"

        耶魯大學的研究人員發現,本地的COVID-19病例可以提供病毒傳播途徑的重要線索。耶魯大學COVID-19實驗室工作組正在利用基因組分析來了解冠狀病毒是如何來到紐黑文的。

        Petrone與博士後助理Joseph Fauver共同撰寫了一項相關研究。在沒有同行評審的情況下發表,以便迅速獲得研究結果,研究顯示,康涅狄格州早期的9例COVID-19來自國內,而非國外,其中7例來自華盛頓州。

        "在一個州不受控製的COVID-19疫情可以在另一個州引發疫情,"Petrone說。"在美國疫情得到控製之前,全國範圍內的每次疫情爆發都必須得到控製。"

        為了更好地了解有多少人患了COVID-19,包括那些沒有症狀的人,耶魯大學的研究人員也在進行基於人群的血清學研究。Foxman的實驗室研究人體對感染的反應。她說,從普通人群中抽取血液樣本,尋找病毒抗體,可以比現場檢查更全麵地了解疾病的傳播情況。

        她和耶魯大學的其他臨床醫生和研究人員正在努力開發血清學測試,以測量抗體,並確定這些抗體是否會阻止未來的感染。

        Foxman說,這"可以幫助科學家預測疫情何時結束。"

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