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早期奧密克戎突變株的檢出和傳播動力學

作者:生物世界 來源:生物世界 日期:2022-01-11
導讀

         近日,最早發現和報告新冠奧密克戎(Omicron)突變株的南非泰倫博斯大學的 Tulio de Oliveira 團隊在 Nature 發表了題為:Rapid epidemic expansion of the SARS-CoV-2 Omicron variant in southern Africa 的研究論文。

        近日,最早發現和報告新冠奧密克戎(Omicron)突變株的南非泰倫博斯大學的 Tulio de Oliveira 團隊在 Nature 發表了題為:Rapid epidemic expansion of the SARS-CoV-2 Omicron variant in southern Africa 的研究論文。

        這篇經過同行評審的研究論文描述了新冠病毒(SARS-CoV-2)變異株奧密克戎(Omicron)在南非被鑒定的經過以及早期的快速傳播。

        奧密克戎的出現和快速傳播對全世界構成了威脅,尤其是對非洲,那裏隻有不到十分之一的人口完成了疫苗的全程接種。Tulio de Oliveira 團隊分析了最早的686例奧密克戎基因組(248例來自南非,438例來自世界其他地區)。

        他們發現,2021年10月末至11月末,奧密克戎從南非的豪登省擴散至南非其餘八個省中的七個省,還擴散到了博茨瓦納的兩個地區。據估計,11月初至12月初的有效再生數約為2.7——有效再生數是指在任何時間點,一名個體在部分易感的人群中平均能傳染的人數。

        截至12月16日,87個國家在南非返回的旅客樣本中或在社區例行檢測的樣本中發現了奧密克戎。截至2022年初,奧密克戎已經在100多個國家被發現,GISAID數據庫現已公開了超過10萬例基因組。

        奧密克戎變異株的獨特之處在於,它的病毒刺突蛋白上有30多個突變。基因型和表型數據顯示,奧密克戎有能力逃逸中和抗體應答。本論文所描述的模擬顯示,免疫逃逸或許是奧密克戎被觀察到的快速傳播能力的一個主要原因。

        論文作者指出,他們的研究結果隻是基於早期的測序數據,有必要對奧密克戎在南非以外國家的傳播進行密切監測,以便更好地理解奧密克戎的傳播性,以及它逃逸既往感染和疫苗誘導免疫力的能力。

        原始出處:

        Raquel Viana , Sikhulile Moyo, et al. Rapid epidemic expansion of the SARS-CoV-2 Omicron variant in southern Africa. Nature, 2022.

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