文章描述了CRDs處方的抗生素治療對呼吸道微生物群的影響，從耐藥性分析的角度描述並比較了用於呼吸道耐藥組分析的技術。
囊性纖維化、重度哮喘、COPD和支氣管擴張等慢性呼吸係統疾病(CRDs)與氣道黏液清除異常有關，可使肺部疾病反複加重。EUROPEAN RESPIRATORY REVIEW雜誌發表了一篇綜述，文章描述了CRDs處方的抗生素治療對呼吸道微生物群的影響，並分析了抗生素類別和治療持續時間之間的差異。其次，從耐藥性分析的角度描述並比較了用於呼吸道耐藥組分析的技術。最後，回顧了目前關於CRDs中呼吸道耐藥組的知識體係，以揭示耐藥組分析在未來抗菌管理策略中的潛力。
研究報道，在進展性CRDs中，使用抗生素可在10年內降低呼吸道微生物組的細菌多樣性，超過年齡和肺功能的影響。耐藥組分析的發展，即抗生素耐藥基因(ARG)的綜合分析，使人們能夠更好地了解抗生素耐藥的機製。ARG通過呼吸道微生物組的傳播可在抗生素治療下的行為及其停藥後的恢複能力中發揮作用。因此，分析呼吸道微生物組內的所有ARG，即分析呼吸道耐藥組，對於理解抗生素治療對呼吸道微生物群落的影響似乎是至關重要的。目前已使用不同的方法來探索呼吸道耐藥組：靶向方法、基於序列的分析、宏基因組分析和三維建模。
研究已確定了健康個體和COPD、支氣管擴張和嚴重哮喘患者常見的呼吸道核心耐藥組。包括β-內酰胺類、二氨基嘧啶類、氟喹諾酮類、大環內酯類、林可黴素類、氯黴素類、氨基糖苷類和四環素類。具有豐富大環內酯類耐藥基因的核心耐藥組存在是CRDs未來管理的最新和關鍵發現。
CRDs與用於預防和治療急性加重發作的抗生素方案相關，可能揭示了抗生素耐藥機製在整個肺部細菌群落中的出現。肺部細菌群落是一個複雜的細菌相互作用網絡。在耐藥性方麵，微生物群落相互作用似乎對基因水平轉移或耐藥酶的遞送具有決定性，耐藥酶可保護其他種屬免受抗生素分子的影響。因此，在CRDs背景下確定細菌對抗生素敏感性的經典技術似乎存在一些局限性。過去幾年中，耐藥組分析使破譯CRDs患者複雜呼吸道微生物組耐藥機製的基因成為可能。這為未來預測和管理這些疾病中細菌耐藥性的新策略提供了視角，根據呼吸道耐藥組實施個性化抗生素治療成為可能。
原文出處：
Pailhoriès H, Herrmann J-L, Velo-Suarez L, et al. Antibiotic resistance in chronic respiratory diseases: from susceptibility testing to the resistome. Eur Respir Rev 2022; [DOI: 10.1183/16000617.0259-2021].
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