浙江大學“基因組科學”研習班邀請北京基因組所於軍教授、胡鬆年教授為您講授基因組學基礎知識和前沿進展、基因轉錄組的測定及分析、基因芯片、二代測序等實驗技術的關鍵事項;浙江大學楊軍教授、陳銘教授等講解係統生物學及高通量分析研究方法和思路。
會議介紹
基因組科學(第31期/總51期)研習班通知
辦學曆史:15年(2002-2016)
開班時間:2017年04月21日-28日(其中21日為全天報到日,22日開始上課)
上機實習內容:
1.基因組數據注釋和功能分析;
2.轉錄組數據分析;
3.蛋白質結構與功能分析;
4.係統生物學軟件實習;
5.蛋白質組學數據分析。
隨著眾多生物基因組測序項目的完成,生物學數據正在加速度增長。如何科學地分析和注釋這些高通量數據,已成為生物學工作者急需學習和解決的問題。
浙江大學“基因組科學”研習班邀請北京基因組所於軍教授、胡鬆年教授為您講授基因組學基礎知識和前沿進展、基因轉錄組的測定及分析、基因芯片、二代測序等實驗技術的關鍵事項;浙江大學楊軍教授、陳銘教授等講解係統生物學及高通量分析研究方法和思路。
本研習班多次獲得浙江大學優秀項目創新獎,目前已舉辦49期,學員來自全國30餘個省市,累計培訓學員4800餘名。每次研習班不乏教授、博導參加,更受到博士後、碩博生等年輕學者的青睞。他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯係,不少學員通過本研習班建立了長期協作關係,共同申請國家973、863課題,共同發表論文,其中不少優秀的研究成果,已在SCI期刊上發表。
一、培訓班上課內容
上課內容涵蓋“基因組學—蛋白質組學—係統生物學”的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。
核心課程包括:
1.基因組的比較研究、DNA測序技術原理與進展(講課人:於軍教授)
2.轉錄組的測定與分析、大規模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與精準醫學(講課人:胡鬆年教授)
3.係統生物學建模分析及高通量分析技術應用(講課人:楊軍、陳銘教授等)
4.蛋白質組學概論及應用(講課人:鍾伯雄教授)
二、培訓班上機內容
上機實習課采用“跟我學”方式,學習實踐各類基礎生物信息學軟件,每人一台PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數據分析的基本方法。
主要內容如下:
實習一:基因組數據注釋和功能分析
通過序列比對工具BLAST的學習,了解基因功能注釋的原理;介紹多序列聯配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4,掌握係統發生樹繪製的基本方法,認識基因複製在進化上的功能。
實習二:轉錄組數據分析
介紹轉錄組數據分析的基本流程及其原理;通過對tophat、cufflinks、R等轉錄組數據分析工具的介紹及演示,了解基於二代測序數據的轉錄組分析流程及常用分析方法;利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉錄組數據的生物學意義。
實習三:係統生物學軟件實習
使用TM4軟件來實現芯片的數據采集,低質量過濾,標準化處理及聚類等可視化分析;使用GenMAPP軟件挖掘芯片數據在代謝途徑中的生物學意義;介紹NCBI GEO數據庫,學習檢索和提交芯片數據。
實習四:蛋白質結構與功能分析
從數據庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始,接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析,預測目標蛋白的生物功能。
實習五:蛋白質組質譜分析
利用Cytoscape係統生物學分析軟件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子網絡係統,並與基因表達等數據整合。
三、培訓對象
1.無生物信息學背景,希望了解生物信息學的學員;
2.計劃開展各類組學研究的科研人員;
3.已有組學數據需了解分析方法的研究人員;
4.有誌從事生物信息學相關工作的學生或者技術人員。
四、報名方法
若有參加意向,請直接報名,我們會即刻回函並在浙江大學繼續教育係統錄入,待排定課表後發給您詳細課程表。待您再次確認後,發給您報到通知並排定上機號。培訓結束,發放浙江大學繼續教育證書。
五、教材
“DNA和蛋白質序列數據分析工具”(第三版),薛慶中等編著,科學出版社出版2012年6月發行。
“基因組學概論”(第二版),薛慶中等編著,科學出版社出版2016年1月發行。
會務組提供。
六、其他事項
收費標準:注冊費為¥3800/人(包含培訓費、教材費、資料費;現金、刷卡或轉賬)食宿可統一安排,費用自理。
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